Depois de conseguirem escapar do labirinto onde se encontraram presos sem explicação, Thomas e os seus companheiros de cativeiro têm de encarar uma realidade diferente, mas nem por isso menos assustadora. Agora, sobrevivendo a condições climáticas adversas e a criaturas disformes chamadas Cranks que desejam devorá-los vivos, eles têm de fazer uma longa e penosa travessia pela Terra Queimada...